Mutasi virus corona mungkin membuatnya lebih menular, demikian temuan penelitian

Result HK

WASHINGTON: Sebuah studi yang melibatkan lebih dari 5.000 pasien Covid-19 di Houston menemukan bahwa virus yang menyebabkan penyakit tersebut mengakumulasi mutasi genetik, yang salah satunya mungkin membuatnya lebih menular.
Menurut makalah yang diterbitkan dalam jurnal peer-review mBIO, mutasi itu, yang disebut D614G, terletak di protein lonjakan yang membuka sel kita untuk masuknya virus. Ini adalah studi peer-review terbesar dari urutan genom SARS-CoV-2 di satu wilayah metropolitan AS hingga saat ini.
Makalah itu menunjukkan “virus bermutasi karena kombinasi pergeseran netral – yang berarti perubahan genetik acak yang tidak membantu atau melukai virus – dan tekanan dari sistem kekebalan kita,” kata Ilya Finkelstein, profesor molekuler. biosciences di The University of Texas di Austin dan rekan penulis studi. Penelitian tersebut dilakukan oleh para ilmuwan di Rumah Sakit Metodis Houston, UT Austin dan di tempat lain.
Selama gelombang awal pandemi, 71% dari virus korona baru yang diidentifikasi pada pasien di Houston mengalami mutasi ini. Ketika gelombang kedua wabah melanda Houston selama musim panas, prevalensi varian ini melonjak menjadi 99,9 persen. Ini mencerminkan tren yang diamati di seluruh dunia. Sebuah studi yang diterbitkan pada bulan Juli berdasarkan lebih dari 28.000 urutan genom menemukan bahwa varian yang membawa mutasi D614G menjadi bentuk SARS-CoV-2 yang dominan secara global dalam waktu sekitar satu bulan. SARS-CoV-2 adalah virus korona yang menyebabkan Covid-19.
Jadi mengapa galur yang mengandung mutasi ini lebih baik dibandingkan galur yang tidak memilikinya?
Mungkin lebih menular. Sebuah studi terhadap lebih dari 25.000 urutan genom di Inggris menemukan bahwa virus dengan mutasi cenderung menularkan sedikit lebih cepat daripada yang tidak dan menyebabkan kelompok infeksi yang lebih besar. Seleksi alam akan menyukai jenis virus yang lebih mudah menular. Tapi tidak semua ilmuwan yakin. Beberapa orang menyarankan penjelasan lain, yang disebut “efek pendiri”. Dalam skenario itu, mutasi D614G mungkin lebih umum pada virus pertama yang tiba di Eropa dan Amerika Utara, pada dasarnya memberi mereka permulaan pada strain lain.
Protein lonjakan juga terus mengakumulasi mutasi tambahan yang tidak diketahui signifikansinya. Tim Houston Methodist-UT Austin juga menunjukkan dalam eksperimen laboratorium bahwa setidaknya satu mutasi semacam itu memungkinkan lonjakan untuk menghindari antibodi penawar yang secara alami diproduksi oleh manusia untuk melawan infeksi SARS-CoV-2. Hal ini memungkinkan varian virus tersebut lebih mudah lolos dari sistem kekebalan kita. Meskipun belum jelas apakah itu diterjemahkan ke dalam itu juga lebih mudah menular antar individu.
Kabar baiknya adalah mutasi ini jarang terjadi dan tampaknya tidak membuat penyakit menjadi lebih parah bagi pasien yang terinfeksi. Menurut Finkelstein, kelompok tersebut tidak melihat virus yang telah belajar menghindari vaksin generasi pertama dan formulasi antibodi terapeutik.
“Virus terus bermutasi saat menyebar ke seluruh dunia,” kata Finkelstein. “Upaya pengawasan waktu nyata seperti penelitian kami akan memastikan bahwa vaksin dan terapi global selalu selangkah lebih maju.”
Para ilmuwan mencatat total 285 mutasi pada ribuan infeksi, meskipun sebagian besar tampaknya tidak berpengaruh signifikan pada seberapa parah penyakit tersebut. Penelitian yang sedang berlangsung terus memantau gelombang ketiga pasien Covid-19 dan untuk mengetahui bagaimana virus beradaptasi dengan antibodi penawar yang diproduksi oleh sistem kekebalan kita. Setiap infeksi baru adalah lemparan dadu, peluang tambahan untuk mengembangkan mutasi yang lebih berbahaya.
“Kami telah memberikan virus ini banyak peluang,” kata penulis utama James Musser dari Houston Methodist kepada The Washington Post. “Ada ukuran populasi yang sangat besar di luar sana sekarang.”
Beberapa penulis UT Austin lainnya berkontribusi pada pekerjaan ini: peneliti tamu Jimmy Gollihar, profesor biosains molekuler Jason S. McLellan dan mahasiswa pascasarjana Chia-Wei Chou, Kamyab Javanmardi dan Hung-Che Kuo.
Tim UT Austin menguji varian genetik yang berbeda dari protein lonjakan virus, bagian yang memungkinkannya menginfeksi sel inang, untuk mengukur stabilitas protein dan untuk melihat seberapa baik ia mengikat ke reseptor pada sel inang dan untuk menetralkan antibodi. Awal tahun ini, McLellan dan timnya di UT Austin, bekerja sama dengan para peneliti di National Institutes of Health, mengembangkan peta 3D pertama dari protein lonjakan virus corona untuk sebuah inovasi yang sekarang menjadi faktor dalam beberapa desain kandidat vaksin terkemuka.
Para peneliti menemukan bahwa SARS-CoV-2 diperkenalkan ke daerah Houston berkali-kali, secara independen, dari berbagai wilayah geografis, dengan strain virus dari Eropa, Asia, Amerika Selatan dan tempat lain di Amerika Serikat. Ada penyebaran komunitas yang luas segera setelah kasus Covid-19 dilaporkan di Houston.
Studi ini didukung oleh Fondren Foundation, Houston Methodist Hospital and Research Institute, National Institutes of Health, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Welch Foundation, National Science Foundation, dan Defense Advanced Research Projects Agency. Ilya Finkelstein adalah sarjana CPRIT dalam penelitian kanker, didanai oleh Institut Penelitian dan Pencegahan Kanker Texas.

By asdjash