Saat virus corona bermutasi, dunia tersandung lagi untuk merespons

Saat virus corona bermutasi, dunia tersandung lagi untuk merespons


DURBAN: Dokter dan perawat di sebuah kelompok rumah sakit Afrika Selatan melihat lonjakan aneh jumlah pasien Covid-19 di bangsal mereka pada akhir Oktober. Pemerintah telah mengendurkan cengkeraman pengunciannya, dan musim semi telah membawa lebih banyak pesta. Tetapi jumlahnya bertambah terlalu cepat untuk dijelaskan dengan mudah, memicu pertanyaan yang menyedihkan.
Apakah ini jenis yang berbeda? seorang pejabat rumah sakit bertanya dalam email grup pada awal November, meningkatkan kemungkinan bahwa virus telah mengembangkan mutasi yang berbahaya.
Pertanyaan itu memicu penyelidikan genetika berisiko tinggi yang dimulai di sini, di Durban, di Samudra Hindia, memberi petunjuk kepada para peneliti di Inggris dan sekarang sedang berlangsung di seluruh dunia. Para ilmuwan telah menemukan varian baru virus yang mengkhawatirkan, yang mengarah pada penutupan perbatasan, karantina, dan penguncian, serta memadamkan antusiasme yang datang dengan vaksin.
Inggris sangat kewalahan. Infeksi dan rawat inap telah meroket dalam beberapa pekan terakhir sejak negara itu menemukan varian virusnya sendiri, yang lebih menular daripada bentuk sebelumnya. Menurut satu perkiraan, virus yang bermutasi sudah bertanggung jawab atas lebih dari 60% infeksi baru di London dan sekitarnya.
Virus korona telah berevolusi saat menyebar ke seluruh dunia, seperti yang diharapkan virus mana pun. Namun para ahli dikejutkan oleh kecepatan munculnya varian baru yang signifikan, menambahkan urgensi baru pada perlombaan antara pertahanan terbaik dunia – vaksinasi, penguncian, dan jarak sosial – dan musuh yang agresif dan selalu berubah.
Varian baru yang menghantam Inggris telah ditemukan di sekitar 45 negara, dari Singapura, Oman, hingga Jamaika, tetapi banyak negara yang secara efektif tidak tahu apa-apa, dengan sedikit rasa betapa buruk masalahnya.
Jauh sebelum pandemi muncul, pejabat kesehatan masyarakat menyerukan pengawasan genetik rutin untuk wabah. Tetapi terlepas dari peringatan bertahun-tahun, banyak negara – termasuk Amerika Serikat – hanya melakukan sebagian kecil dari studi genom yang diperlukan untuk menentukan seberapa umum mutasi virus itu.
Denmark, yang telah berinvestasi dalam pengawasan genetik, menemukan varian yang menyerang Inggris di beberapa wilayah Denmark dan baru-baru ini memperketat pembatasan. Menteri kesehatan membandingkannya dengan gelombang badai, memprediksi bahwa itu akan mendominasi varian lain pada pertengahan Februari.
Dan seiring dengan pencarian negara, mereka juga menemukan varian lain.
Dengan dunia tersandung dalam peluncuran vaksinasi dan jumlah kasus meningkat tajam ke puncak yang melebihi yang terlihat pada musim semi lalu, para ilmuwan melihat kebutuhan mendesak untuk mengimunisasi sebanyak mungkin orang sebelum virus cukup berkembang untuk membuat vaksin impoten.
“Ini berpacu dengan waktu,” kata Marion Koopmans, ahli virus Belanda dan anggota kelompok kerja Organisasi Kesehatan Dunia untuk adaptasi virus korona.
Vaksin saja tidak akan cukup untuk mendahului virus. Perlu waktu bertahun-tahun untuk menyuntik cukup banyak orang untuk membatasi evolusinya. Sementara itu, jarak sosial, pemakaian topeng dan cuci tangan – ditambah dengan pengujian agresif, pelacakan dan pelacakan – mungkin mengulur waktu dan mencegah lonjakan yang menghancurkan dalam rawat inap dan kematian di sepanjang jalan. Strategi ini masih bisa membalikkan keadaan melawan virus, kata para ahli.
“Kami tahu cara mengurangi penularan virus melalui perilaku kami,” kata Carl Bergstrom, seorang ahli biologi evolusi di University of Washington di Seattle. “Kami punya banyak agen di sana.”
Namun selama pandemi, pemerintah sering kali terbukti enggan atau tidak mampu menggalang dukungan untuk pertahanan dasar tersebut. Banyak negara sudah menyerah pada pelacakan dan penelusuran. Pemakaian topeng tetap bermuatan politik di Amerika Serikat, meskipun ada bukti yang jelas tentang kemanjurannya. Kota-kota seperti Los Angeles telah dicengkeram oleh lonjakan kasus yang terkait dengan perayaan Natal, dan pejabat kesehatan masyarakat nasional bersiap menghadapi lonjakan di tempat lain, didorong oleh orang-orang yang mengabaikan nasihat dan bepergian selama liburan.
Masih banyak yang belum diketahui tentang varian baru atau bahkan berapa banyak yang tumbuh di seluruh dunia. Para ilmuwan berlomba untuk mengurutkan cukup virus untuk mengetahui, tetapi hanya sedikit negara yang memiliki sarana atau komitmen untuk melakukannya.
Penyebaran varian yang cepat adalah pengingat akan kegagalan dan kesalahan langkah negara-negara besar sebelumnya dalam menahan virus. Sama seperti China yang gagal menghentikan pelancong menyebarkan virus sebelum Tahun Baru Imlek tahun lalu, Inggris gagal bergerak cukup cepat menjelang penyebaran varian baru. Inggris menurunkan kewaspadaannya selama liburan, meskipun ada peningkatan kasus yang sekarang diketahui terkait dengan varian. Dan seperti China yang menjadi paria sejak awal, Inggris sekarang memiliki perbedaan yang tidak menguntungkan karena disebut Pulau Wabah.
Penyebaran varian cambuk Inggris telah membuat beberapa negara rentan pada saat mereka tampak di ambang keselamatan ilmiah. Contoh kasus: Israel. Negara itu, yang telah meluncurkan peluncuran vaksin yang sangat sukses, memperketat pengunciannya pada Jumat setelah menemukan kasus varian. Sekitar 8.000 infeksi baru setiap hari telah terdeteksi dalam beberapa hari terakhir, dan tingkat penyebaran di komunitas ultra-Ortodoks telah meningkat secara drastis.
Varian yang ditemukan di Inggris, yang dikenal sebagai B.1.1.7, memiliki 23 mutasi yang berbeda dari versi virus yang paling awal diketahui di Wuhan, Cina, termasuk satu atau lebih yang membuatnya lebih menular dan setidaknya satu yang sedikit melemahkan vaksin. potensi. Beberapa eksperimen menunjukkan bahwa varian tersebut menyebar lebih mudah karena mutasi memungkinkannya untuk lebih berhasil menempel ke jalan napas seseorang.
Bergstrom dan ilmuwan lain terkejut melihat varian yang lebih mudah menular ini muncul, mengingat virus korona sudah cukup mahir dalam menginfeksi manusia. Tetapi para ahli lain telah memperingatkan sejak awal bahwa hanya masalah waktu sebelum virus menjadi musuh yang lebih tangguh.
“Setiap situasi yang telah kami pelajari secara mendalam di mana virus telah melompat ke spesies baru, menjadi lebih menular dari waktu ke waktu,” kata Andrew Read, seorang ahli mikrobiologi evolusi di Penn State University. “Ia berkembang karena seleksi alam menjadi lebih baik, dan itulah yang terjadi di sini.”
Sebagian besar tanggapan global berfokus pada penutupan Inggris, dengan campur aduk pembatasan nasional yang mengingatkan kembali pada reaksi awal terhadap epidemi.
Para ahli mengatakan bahwa negara-negara harus fokus pada peningkatan vaksinasi, terutama di antara pekerja penting yang menghadapi risiko tinggi dengan sedikit sumber daya untuk melindungi diri mereka sendiri. Semakin lama virus menyebar di antara yang tidak divaksinasi, semakin banyak mutasi yang mungkin terkumpul yang dapat melemahkan efektivitas vaksin.
Itulah sebabnya, ketika kelompok kerja WHO melihat data pertama tentang varian tersebut beredar di Afrika Selatan pada 4 Desember, semua orang memperhatikan.
Pertanyaan Anda berikutnya segera adalah, apakah vaksin masih dapat melindungi kita jika kita terkena virus dengan mutasi ini? kata Koopmans, yang hadir dalam pertemuan itu.
Untuk saat ini, jawabannya sepertinya ya, kata Jesse Bloom, seorang ahli biologi evolusi di Fred Hutchinson Cancer Research Center di Seattle. Koopmans setuju.
Varian yang muncul di Afrika Selatan dan Brasil merupakan ancaman khusus bagi upaya imunisasi karena keduanya mengandung mutasi yang terkait dengan penurunan efektivitas vaksin. Dalam satu percobaan, yang dirancang untuk mengidentifikasi skenario terburuk, tim Bloom menganalisis 4.000 mutasi, mencari yang akan membuat vaksin tidak berguna. Mutasi varian dari Brasil dan Afrika Selatan memiliki dampak terbesar.
Namun, setiap sampel serum dalam penelitian ini menetralkan virus, terlepas dari mutasinya, kata Bloom, menambahkan bahwa perlu beberapa tahun sebelum vaksin perlu disesuaikan. “Harus ada banyak waktu di mana kami bisa menjadi calon, mengidentifikasi mutasi ini dan mungkin memperbarui vaksin tepat waktu,” katanya.
Pengawasan semacam itulah yang menyebabkan ditemukannya varian baru.
Liza Sitharam, seorang perawat dan spesialis penyakit menular di pesisir Afrika Selatan, termasuk di antara mereka yang pertama kali memperhatikan sekelompok kecil yang membengkak dengan cepat. “Kami memiliki lima kasus, dan kemudian akan berlipat ganda dengan sangat cepat,” kenangnya. Jumlah mentahnya tidak mengkhawatirkan, katanya, tapi “ada sesuatu yang tidak beres.”
Bosnya di grup rumah sakit Netcare, Dr. Caroline Maslo, memperkirakan bahwa dengan perbatasan negara terbuka, pelancong bisnis dari perusahaan mobil Jerman mungkin membawa varian Eropa. Dia mencari bantuan dari Tulio de Oliveira, seorang profesor dan ahli genetika di Sekolah Kedokteran Nelson Mandela di Durban yang telah mempelajari varian virus selama gelombang Covid-19 pertama.
Segera labnya menganalisis penyeka, dikirim dengan es melalui kurir semalaman. Pada 1 Desember, dia mengirim email kepada seorang ilmuwan Inggris, Andrew Rambaut, dan memintanya untuk meninjau beberapa temuan awal: serangkaian mutasi aneh di permukaan luar virus.
De Oliveira, seorang ilmuwan Afrika Selatan Brasil yang memiliki rambut panjang dan aura peselancar, membagikan temuannya pada pertemuan kelompok kerja WHO pada 4 Desember. Semua memperhatikan karena varian tersebut berpotensi mengganggu efektivitas vaksin.
Beberapa hari kemudian, kenangnya, Rambaut mengirim email kepadanya dengan penemuannya sendiri: ilmuwan Inggris telah menjelajahi database mereka dan menemukan mutasi serupa tetapi tidak terkait yang tampaknya terkait dengan sekelompok infeksi di daerah Kent.
Itu terjadi dua minggu sebelum Natal, dan de Oliveira segera memikirkan Tahun Baru Imlek di awal pandemi, ketika jutaan orang di China melakukan perjalanan jauh untuk liburan, beberapa membawa virus. “Itu sangat jelas,” kata de Oliveira dalam sebuah wawancara. Varian ini akan menyebar secara nasional, regional dan global.
Rambaut dan rekannya merilis makalah tentang varian yang ditemukan di Inggris pada 19 Desember – hari yang sama para pejabat Inggris mengumumkan langkah-langkah baru. Varian tersebut tampaknya telah beredar tanpa terdeteksi pada awal September. Rambaut sejak itu memuji tim Afrika Selatan dengan tip yang menyebabkan penemuan varian melonjak di Inggris.
Pejabat kesehatan masyarakat secara resmi merekomendasikan jenis pengawasan genetik cepat dan berbagi informasi sebagai salah satu kunci untuk tetap berada di atas virus yang terus berubah. Tetapi mereka telah menyerukan pengawasan rutin seperti itu selama bertahun-tahun, dengan hasil yang beragam.
“Pesannya sangat jelas bahwa inilah jalan yang harus ditempuh pengawasan,” kata Dr. Josep Jansa, peneliti kesehatan masyarakat senior di Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa. Sama seperti Covid-19 yang mengungkap kelemahan dalam rencana pandemi dunia setahun yang lalu, perburuan varian baru membuka celah dalam pengawasan. “Kami sedang belajar,” katanya. “Perlahan.”
Inggris memiliki salah satu regimen pengawasan paling agresif, menganalisis hingga 10% sampel yang dites positif terkena virus. Tetapi hanya sedikit negara yang memiliki sistem yang kuat. Amerika Serikat mengurutkan kurang dari 1% sampel positifnya. Dan yang lain tidak dapat berharap untuk membeli peralatan atau membangun jaringan seperti itu pada saat pandemi ini.
Di Brasil, laboratorium yang mengalihkan perhatian mereka dari Zika ke virus corona telah menemukan mutasi yang mengkhawatirkan di sana sejak musim semi ini. Tetapi sedikit yang diketahui tentang varian yang beredar di negara tersebut atau seberapa cepat penyebarannya. “Kami tidak tahu karena tidak ada yang mengurutkan atau berbagi data,” kata Dr. Nuno Faria dari Imperial College dan Universitas Oxford, yang mengoordinasikan proyek pengurutan genom dengan rekannya di Brasil. “Pengawasan genom mahal.”
Saat virus terus bermutasi, varian penting lainnya hampir pasti akan muncul. Dan virus yang membuat virus lebih keras atau lebih menular akan lebih mungkin menyebar, kata Read. “Semakin cepat kami mengeluarkan vaksin, semakin cepat kami dapat mengatasi varian ini,” katanya. Tidak ada ruang untuk berpuas diri di sini.

Pengeluaran HK